Una técnica de secuenciación para la fibrosis quística

Mediante la secuenciación masiva del gen CFTR, se analizó toda la secuencia codificante y los bordes exón-intrón del gen CFTR buscando mutaciones. El resultado de las secuencias obtenidas para cada individuo fueron comparadas con la secuencia consenso de CFTR mediante software, todas las variantes detectadas se confirmaron con secuenciación por el método de Sanger y se contrastaron con los datos alojadas en las principales bases de datos de fibrosis quística. 

La secuenciación tiene limitaciones ya que no permite detectar rearreglos, como deleciones y duplicaciones del gen CFTR que también son causa de enfermedad, para ello será necesario analizar con técnicas complementarias. 

Información obtenida de: 

https://genotipia.com/wp-content/uploads/2019/04/GMG3-67-73-Armas-web.pdf

 Una prueba PCR (Reacción en Cadena de la Polimerasa) para la fibrosis quística

En este caso se obtuvo ADN genómico a partir de sangre y el mismo se amplificó por PCR con cebadores específicos para el exón 10, el producto de amplificación se incubó con la enzima de restricción Mbol a 37°C. Para amplificar el exón 10 del CFTR se utilizó un cebador 5’ que introduce parte de la secuencia del sitio de corte para la enzima Mbol; ésta es completada en el alelo sano por el triplete CTT, pero no en el alelo afectado. El cebador 3’ se eligió para contar con un control interno de actividad enzimática. Finalmente se detectó la mutación F508del en la mayoría de pacientes. 

Información obtenida de: 

http://www.scielo.org.pe/pdf/rins/v34n1/a09v34n1.pdf

 Alteraciones de la Epigenómica en la fibrosis quística

La herencia es un factor clave en la fibrosis quística, pues esta enfermedad se transmite de padres a hijos de forma autosómica recesiva, ya que se desarrolla cuando los dos alelos procedentes, uno de cada progenitor, no son funcionales, es decir, presentan mutaciones en el gen CFTR. Por otro lado, esta enfermedad genética, es más frecuente en la población caucásica, de tez blanca y con ancestros españoles, no se ha reportado incidencia según el sexo. 

Información obtenida de: 
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1695403318305393?via%3Dihub
http://revgenetica.sld.cu/index.php/gen/article/view/69/108

 Alteración de la traducción en la fibrosis quística

El gen CFTR codifica una proteína de 1480 aminoácidos denominada regulador de la conductancia transmembrana de la fibrosis quística (CFTR), con un peso molecular de aproximadamente 170kDa. La mutación más frecuente es la deleción de tres pares de bases en el exón 10 del gen, que provoca la pérdida del aminoácido fenilalanina, ubicado en la posición 508 de la proteína, alteración conocida como F508del. 

Información obtenida de:

https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7147672/